由上篇可知，医学不是岐伯、黄帝讨论出来的，而是逐渐累积发展起来的。于是，经典并非不能更改，而要不断通过实践，去验证理论、修正理论。今日，吾人已置身于历史的十字路口，焉能不有所为。
中医的本体论：天人一体、天人相通、天人合一。
人是世界的一部分，整个世界都是由精微之物组成。人与外界可以交换组成部分。天人合一是中国哲学思想的灵魂，是许多人朴素的世界观，也是中医最基本的理念。天人分离，导致了疾病、烦恼、灾祸。天人合一，才能健康、愉悦、幸福。顺应自然才能天人合一，反自然会使天人分离。
精气神
精者，宇宙之本原也！为一元本体论。中西方均有诸多一元论，如火本论、水本论，原子论等。人是宇宙的一部分，所以人也是由精组成。精是超现象、微不可见闻的，故又称精微。宇宙万物都由精微组成，故以人的角度看，自身之精微即內精，外物之精微为外精。人皆由父母而生，由男精和女精结合而成，此先天之元精也。人由元精而生，自胎腹就不断吸收外精，渐而成人。
气者，精之所化也。人之摄外精：一由饮食、一由吐纳。空气由气体、水份和微量成份组成。而吐纳包括肺呼吸和皮表腠理呼吸。人通过吐纳摄取有形外气而补內精，而內精又可以化为无形内气。人一身之气，本由精生。精气实为一体，气为能量状态，精为物资状态。精生气犹木生火，气化精犹火燃木。精气平衡、转化顺畅，则健康，反之则病变。
精气化为无形者：神。仁、义、礼、智、信诸属，皆神之所主。神失形则无寓，形失神则为尸。形神分离者，失眠也。神之乱者：烦躁、郁闷、忿恚。神之病者：颠、狂、卑、怯、恐、懵。
气虽周布全身，却统聚于中；精藏于下；神摄于上。督脉统领诸阳，精藏于命门穴以下，气统于命门穴以上、哑门穴以下，神扬于哑门穴以上。精如屋基，气如屋架，神如屋顶。
劳心过度，神伤日久，必累及气与精；气虚日久，必使精亏，而神无所依；精亏日久，必使气下陷，而神不得清扬。精亏则腰膝酸软，肢寒畏冷；气虚则吐纳、运化失调；神伤则健忘、迟钝、茫然若有所失。临床常诸症并见，看似纷繁，其理一也！精宜纳、气宜行、神当清扬。精盈则气盛，气盛则神扬。
津亏而神浮散，使人烦；津多而神溺，使人呆讷；精亏而神无所养，使人神弱；气滞而神不扬，使人昏；痰浊而神不清，使人闭。
卫气营血
气分有两途，一呼吸、一饮食。《素问·六节藏象论篇第九》曰：天食人以五气，地食人以五味。五气入鼻，藏于心肺，上使五色修明，音声能彰；五味入口，藏于肠胃，味有所藏，以养五气，气和而生，津液相成，神乃自生。
呼吸者：肺为气分之始，心气传导于中，气化精微沉于肾，肾为气分之根。饮食者：胃为气分之始，肠道传导于中，成精微于肝，故肝为气分之末。肝生血，为血分之始，心传导于周身，入肾排其溲溺，肾为血分之末。-----故肾既为气之根，又为血之终。
饮食下肚，糟粕由大肠而下，精微入于肝。肝则生阴血，阴血输于肺与氧气(阳)结合，输回于心，再周布全身。输于肢体者，带回污秽，阳秽输于肺排除，阴秽输于膀胱排出。肝阴又由心输于肾，而成肾阴。肾阴生肾阳，肾阳入督脉散布于全身，温煦全身筋骨、十二经络、奇经八脉。故曰：肝阴不降、肾阳不生。心亢者肝阴亦不能沉降，肾阴虚、日久必至阳虚。此人体阴阳生化之道，不明此理者，难为明医！
气者，无处不在，司呼吸、主运化、行血脉、开阖腠理、藏精养神。气不行，必生诸变。脉外之气曰卫气；脉内之气曰营气；肺胃之气曰宗气(人体摄生由此两途，肺胃为气之源，故曰宗)；先天之气曰元气。气在脏腑曰：心气、肝气、胃气、脾气、肾气诸等。又有中气之谓，中气非独一脏腑之气，乃主运化、司吐纳之气，诸脏腑共司之，上养神，下藏精。
古者谓血旺者“荣”，血枯者“失荣”。古之“荣”“营”同音，常混相杂用。余以为实有别也！荣血者，血中津水、精微也；营气者，行血之气也。今人所谓之“高血压”，营气旺也，非荣血旺。
阳虚自汗，卫虚使腠理自开，故谓之卫弱营强；实非营强，卫自虚也，故不发热也。桂枝汤证，营气、荣血俱旺，虽风寒袭表，然营气迫血中津水外溢，故发热自汗。凡发热自汗者，不可复用麻黄迫血中水外溢。
麻黄汤证，风寒郁闭营卫，气血闭于里则水津逆行，故多涕、唾、涎水。必以桂枝通阳行气，以麻黄迫血中水外溢以发汗，是以多用麻黄则伤阴，故麻黄汤证当多喝开水。
穴位与经络
针灸起源于疼痛，最开始按压、按摩。人们疼痛的时候，会自然的用手按压、按摩疼痛部位，这就是所谓“阿是穴”的起源。逐渐，人们发现按压其它特定部位，反而效果更好，这就是穴位的起源。按压穴位时，会导致疼痛、或麻胀感传递，而且路径相对固定，这便是经络的起源。
按之不足，便击打之、摩擦之，推拿之，熨烫之、针刺之，这便是推拿、刮痧、拔罐、艾灸、针刺的起源。人们受伤体表有瘀血时，便会刺破皮肤，排放瘀血。后来发现，刮痧、拔罐能够使组织中的积痰瘀血溢出，也能将脏腑积痰瘀血导于皮下，再刺而放之。于是又在此基础上放血治疗。积痰瘀血既除，则经络气血通畅，则病愈！
穴位的发现肯定早于经络。随着穴位增多，又发现了穴位之间的联系，于是产生了经络。经络不包括大血管、主神经、大淋巴腺体，但是却与血管、神经、淋巴三大系统密切相关。穴位分布于小血管、神经末梢、淋巴末梢周边，通过对末梢的刺激，影响这三大系统，从而达到治病的目的。三大系统以血液系统为统帅，故药物治疗淋巴疾病和神经疾病时都以理血药开路，这也是针砭放血、刮痧的治病原理。
经络就隐藏在这三大系统之间，是看不见的存在。神经系统如轮毂，淋巴系统如内胎，血液系统如外胎，那么经络就是充斥其中的空气。而穴位就是气孔，气孔可以充气、也可以泄气；与车轮气孔不同的是，经络上的气孔不止一个。
上篇回顾了经络学的发展史：四经、五经、六经学派，经气都是上行的，即由足向头。因为气本性上行，浊阴下沉；从临床实践来看，寒从脚入，由下而上。而手六经主要用于内伤疾病辨证，经气可能是由里走向指端的。到了十二经学派，将十二经按表里关系排列，经气始于手太阴肺经，最后传至足厥阴肝经，又传回手太阴肺经。如此罔替不竭。余以为此说实源于藏象学派，以十二脏腑匹配十二时辰，可取之处颇多、符合临床实践。但十二经气巡行次序，其有助于临床者多少，就不得而知了。
早期经络并不联系脏腑，而《甲乙经》之俞穴分类法则是受藏象学派影响的产物。宋代以前，流行的是《甲乙经》之俞穴分类法，这是因为《灵枢经》一度失传。今传《灵枢经》主体部分应成书于东汉末年，但是其中涉及“相术、乐理、风水”等部分，是六朝人添加。因为《难经》《脉经》《针灸甲乙经》均未提到这些内容。《伤寒论》的内容与《素问》交集颇多，而与《灵枢经》却几乎不相干。因此：以十二经络为理论基础的经脉分类法、以经统穴法，肯定是后起之秀。
有形之液态者：津、血、痰涎唾。《伤寒论》云：风家禁汗，亡血家禁汗，湿家禁汗，疮家禁汗。惜未言其所以然，以致学者茫然。余尝思之，无非津与血。西学论血液循环系统，血与体液可通过毛细血管互通有无。津中水满则渗入血，血中水满则渗入津；津枯则血中水补之；血枯则津中水补之。仲景四禁，皆因不可亡其血也(使血容量降低)。发汗必亏其津，遂使血中水补津之不足，必致亡血。
生脉散，是以人参、麦冬促进水的吸收、运化，五味子收涩保水。大剂量服用可迅速增加血容量，故得其名。三才汤又不同，增血中之水而不收敛，血中之水又经尿外排。故无生脉急救之能，而善补周身之津，排血中之热，又无敛邪之虞，不亦善哉！凡忌亡血者，发汗、泻下、利尿均不宜。输液能救阴，但不能补阴。因不能治本，只适合救急，不能作为滋阴之常态疗法。
古人区分了唾、涎、痰。唾乃体液从口腔外溢，故肾寒而唾增，骤寒而骤增。从口腔上部溢出唾液，是肾水；从舌底溢出唾液，是脾水。故肾为先天之本，脾为后天之本。舌底溢水，是真虚！当培土制水！
狭义之痰，即肺中嗽出之痰。所谓阻滞经络之痰就是涎。身体异常导致脾胆分泌、胃肠运化、肝脏代谢失常，本当代谢的粘腻物进入血液，继而进入体液、经络、脏腑……这就是涎。唾粘而长垂，即已成涎。忧愁思虑、忿恚抑郁，最易引起此类病变。涎随血液进入肺部，则风干浓缩为痰。肺部的不同病变，导致不同类型的痰。风痰粘而不浓，起泡、垂而不断，实由消化系统功能受损所至，故治疗重不在肺。疏肝、利胆、健脾、和胃、利水、泻下、补气、温阳，均是化痰之法。
痰再浓缩，即成积聚、痰瘤；与血共同硬结者，为血瘤，即成岩证。故消化正常者，多无痰。若无痰，肺病不过有咳无嗽、有喘无哮。又有肝气旺者，粘腻物被肝脏吸收，积聚于肝最易成肝病。瘦而岩证者，多属阳亢阴虚，当以汲水洗血、化痰为第一法。
凡人体运动少的部位气血易滞，就是淋巴组织多的部位。从颈侧、咽喉到心窝，从左腋窝贯穿双乳到右腋窝，这两条线的交叉点就是膻中。膻中是人体交通中心、十字路口，体液中的痰最易郁结于此。心脏是血液系统的中心，冠脉最易堵塞，血液中的痰最易郁结于心包络。藏相学最早只有十一脏腑，后来才加了膻中，又有易为心包络者。其实膻中和心包络位置相近、密切相关，完全可以视作一个脏腑两个方面，病在气分即在膻中，病在血分即在心包络。临床上膻中、心包络常同病，治疗二者痰阻瘀滞的常用药也基本一致：枳实、桃仁、郁金、瓜蒌籽、石菖蒲等。成方则有大小陷胸法。
有形之固态者：筋骨、皮肉、毛发、脏腑。
中医的脏腑理论是起源于人体解剖的。但是，随着我们对脏腑相互影响的认识越来越深，完全超越了人体解剖所能解释的，特别是脏腑之间的相互影响、疾病的传变，不全是解剖学能够验证。通过人体解剖并结合临床医学实践，医学家们创立了一种部分超出经验的中医理论：藏相学说。藏相学说来源于经验，并不能完全被解剖学所验证，但能被临床医学所验证。
遗憾的是，汉代医学家这种经验与理性并重、归纳和演绎结合的理念，并没有被后代医学家所完全继承。首先是被魏晋玄学神秘化，特别是自赵宋以来，脱离经验、实践去玄谈的风气日益盛行。这导致了藏相学说在汉代以后几无进步。
中医的本体论：天人一体、天人相通、天人合一。
人是世界的一部分，整个世界都是由精微之物组成。人与外界可以交换组成部分。天人合一是中国哲学思想的灵魂，是许多人朴素的世界观，也是中医最基本的理念。天人分离，导致了疾病、烦恼、灾祸。天人合一，才能健康、愉悦、幸福。顺应自然才能天人合一，反自然会使天人分离。
精气神
精者，宇宙之本原也！为一元本体论。中西方均有诸多一元论，如火本论、水本论，原子论等。人是宇宙的一部分，所以人也是由精组成。精是超现象、微不可见闻的，故又称精微。宇宙万物都由精微组成，故以人的角度看，自身之精微即內精，外物之精微为外精。人皆由父母而生，由男精和女精结合而成，此先天之元精也。人由元精而生，自胎腹就不断吸收外精，渐而成人。
气者，精之所化也。人之摄外精：一由饮食、一由吐纳。空气由气体、水份和微量成份组成。而吐纳包括肺呼吸和皮表腠理呼吸。人通过吐纳摄取有形外气而补內精，而內精又可以化为无形内气。人一身之气，本由精生。精气实为一体，气为能量状态，精为物资状态。精生气犹木生火，气化精犹火燃木。精气平衡、转化顺畅，则健康，反之则病变。
精气化为无形者：神。仁、义、礼、智、信诸属，皆神之所主。神失形则无寓，形失神则为尸。形神分离者，失眠也。神之乱者：烦躁、郁闷、忿恚。神之病者：颠、狂、卑、怯、恐、懵。
气虽周布全身，却统聚于中；精藏于下；神摄于上。督脉统领诸阳，精藏于命门穴以下，气统于命门穴以上、哑门穴以下，神扬于哑门穴以上。精如屋基，气如屋架，神如屋顶。
劳心过度，神伤日久，必累及气与精；气虚日久，必使精亏，而神无所依；精亏日久，必使气下陷，而神不得清扬。精亏则腰膝酸软，肢寒畏冷；气虚则吐纳、运化失调；神伤则健忘、迟钝、茫然若有所失。临床常诸症并见，看似纷繁，其理一也！精宜纳、气宜行、神当清扬。精盈则气盛，气盛则神扬。
津亏而神浮散，使人烦；津多而神溺，使人呆讷；精亏而神无所养，使人神弱；气滞而神不扬，使人昏；痰浊而神不清，使人闭。
卫气营血
气分有两途，一呼吸、一饮食。《素问·六节藏象论篇第九》曰：天食人以五气，地食人以五味。五气入鼻，藏于心肺，上使五色修明，音声能彰；五味入口，藏于肠胃，味有所藏，以养五气，气和而生，津液相成，神乃自生。
呼吸者：肺为气分之始，心气传导于中，气化精微沉于肾，肾为气分之根。饮食者：胃为气分之始，肠道传导于中，成精微于肝，故肝为气分之末。肝生血，为血分之始，心传导于周身，入肾排其溲溺，肾为血分之末。-----故肾既为气之根，又为血之终。
饮食下肚，糟粕由大肠而下，精微入于肝。肝则生阴血，阴血输于肺与氧气(阳)结合，输回于心，再周布全身。输于肢体者，带回污秽，阳秽输于肺排除，阴秽输于膀胱排出。肝阴又由心输于肾，而成肾阴。肾阴生肾阳，肾阳入督脉散布于全身，温煦全身筋骨、十二经络、奇经八脉。故曰：肝阴不降、肾阳不生。心亢者肝阴亦不能沉降，肾阴虚、日久必至阳虚。此人体阴阳生化之道，不明此理者，难为明医！
气者，无处不在，司呼吸、主运化、行血脉、开阖腠理、藏精养神。气不行，必生诸变。脉外之气曰卫气；脉内之气曰营气；肺胃之气曰宗气(人体摄生由此两途，肺胃为气之源，故曰宗)；先天之气曰元气。气在脏腑曰：心气、肝气、胃气、脾气、肾气诸等。又有中气之谓，中气非独一脏腑之气，乃主运化、司吐纳之气，诸脏腑共司之，上养神，下藏精。
古者谓血旺者“荣”，血枯者“失荣”。古之“荣”“营”同音，常混相杂用。余以为实有别也！荣血者，血中津水、精微也；营气者，行血之气也。今人所谓之“高血压”，营气旺也，非荣血旺。
阳虚自汗，卫虚使腠理自开，故谓之卫弱营强；实非营强，卫自虚也，故不发热也。桂枝汤证，营气、荣血俱旺，虽风寒袭表，然营气迫血中津水外溢，故发热自汗。凡发热自汗者，不可复用麻黄迫血中水外溢。
麻黄汤证，风寒郁闭营卫，气血闭于里则水津逆行，故多涕、唾、涎水。必以桂枝通阳行气，以麻黄迫血中水外溢以发汗，是以多用麻黄则伤阴，故麻黄汤证当多喝开水。
穴位与经络
针灸起源于疼痛，最开始按压、按摩。人们疼痛的时候，会自然的用手按压、按摩疼痛部位，这就是所谓“阿是穴”的起源。逐渐，人们发现按压其它特定部位，反而效果更好，这就是穴位的起源。按压穴位时，会导致疼痛、或麻胀感传递，而且路径相对固定，这便是经络的起源。
按之不足，便击打之、摩擦之，推拿之，熨烫之、针刺之，这便是推拿、刮痧、拔罐、艾灸、针刺的起源。人们受伤体表有瘀血时，便会刺破皮肤，排放瘀血。后来发现，刮痧、拔罐能够使组织中的积痰瘀血溢出，也能将脏腑积痰瘀血导于皮下，再刺而放之。于是又在此基础上放血治疗。积痰瘀血既除，则经络气血通畅，则病愈！
穴位的发现肯定早于经络。随着穴位增多，又发现了穴位之间的联系，于是产生了经络。经络不包括大血管、主神经、大淋巴腺体，但是却与血管、神经、淋巴三大系统密切相关。穴位分布于小血管、神经末梢、淋巴末梢周边，通过对末梢的刺激，影响这三大系统，从而达到治病的目的。三大系统以血液系统为统帅，故药物治疗淋巴疾病和神经疾病时都以理血药开路，这也是针砭放血、刮痧的治病原理。
经络就隐藏在这三大系统之间，是看不见的存在。神经系统如轮毂，淋巴系统如内胎，血液系统如外胎，那么经络就是充斥其中的空气。而穴位就是气孔，气孔可以充气、也可以泄气；与车轮气孔不同的是，经络上的气孔不止一个。
上篇回顾了经络学的发展史：四经、五经、六经学派，经气都是上行的，即由足向头。因为气本性上行，浊阴下沉；从临床实践来看，寒从脚入，由下而上。而手六经主要用于内伤疾病辨证，经气可能是由里走向指端的。到了十二经学派，将十二经按表里关系排列，经气始于手太阴肺经，最后传至足厥阴肝经，又传回手太阴肺经。如此罔替不竭。余以为此说实源于藏象学派，以十二脏腑匹配十二时辰，可取之处颇多、符合临床实践。但十二经气巡行次序，其有助于临床者多少，就不得而知了。
早期经络并不联系脏腑，而《甲乙经》之俞穴分类法则是受藏象学派影响的产物。宋代以前，流行的是《甲乙经》之俞穴分类法，这是因为《灵枢经》一度失传。今传《灵枢经》主体部分应成书于东汉末年，但是其中涉及“相术、乐理、风水”等部分，是六朝人添加。因为《难经》《脉经》《针灸甲乙经》均未提到这些内容。《伤寒论》的内容与《素问》交集颇多，而与《灵枢经》却几乎不相干。因此：以十二经络为理论基础的经脉分类法、以经统穴法，肯定是后起之秀。
有形之液态者：津、血、痰涎唾。《伤寒论》云：风家禁汗，亡血家禁汗，湿家禁汗，疮家禁汗。惜未言其所以然，以致学者茫然。余尝思之，无非津与血。西学论血液循环系统，血与体液可通过毛细血管互通有无。津中水满则渗入血，血中水满则渗入津；津枯则血中水补之；血枯则津中水补之。仲景四禁，皆因不可亡其血也(使血容量降低)。发汗必亏其津，遂使血中水补津之不足，必致亡血。
生脉散，是以人参、麦冬促进水的吸收、运化，五味子收涩保水。大剂量服用可迅速增加血容量，故得其名。三才汤又不同，增血中之水而不收敛，血中之水又经尿外排。故无生脉急救之能，而善补周身之津，排血中之热，又无敛邪之虞，不亦善哉！凡忌亡血者，发汗、泻下、利尿均不宜。输液能救阴，但不能补阴。因不能治本，只适合救急，不能作为滋阴之常态疗法。
古人区分了唾、涎、痰。唾乃体液从口腔外溢，故肾寒而唾增，骤寒而骤增。从口腔上部溢出唾液，是肾水；从舌底溢出唾液，是脾水。故肾为先天之本，脾为后天之本。舌底溢水，是真虚！当培土制水！
狭义之痰，即肺中嗽出之痰。所谓阻滞经络之痰就是涎。身体异常导致脾胆分泌、胃肠运化、肝脏代谢失常，本当代谢的粘腻物进入血液，继而进入体液、经络、脏腑……这就是涎。唾粘而长垂，即已成涎。忧愁思虑、忿恚抑郁，最易引起此类病变。涎随血液进入肺部，则风干浓缩为痰。肺部的不同病变，导致不同类型的痰。风痰粘而不浓，起泡、垂而不断，实由消化系统功能受损所至，故治疗重不在肺。疏肝、利胆、健脾、和胃、利水、泻下、补气、温阳，均是化痰之法。
痰再浓缩，即成积聚、痰瘤；与血共同硬结者，为血瘤，即成岩证。故消化正常者，多无痰。若无痰，肺病不过有咳无嗽、有喘无哮。又有肝气旺者，粘腻物被肝脏吸收，积聚于肝最易成肝病。瘦而岩证者，多属阳亢阴虚，当以汲水洗血、化痰为第一法。
凡人体运动少的部位气血易滞，就是淋巴组织多的部位。从颈侧、咽喉到心窝，从左腋窝贯穿双乳到右腋窝，这两条线的交叉点就是膻中。膻中是人体交通中心、十字路口，体液中的痰最易郁结于此。心脏是血液系统的中心，冠脉最易堵塞，血液中的痰最易郁结于心包络。藏相学最早只有十一脏腑，后来才加了膻中，又有易为心包络者。其实膻中和心包络位置相近、密切相关，完全可以视作一个脏腑两个方面，病在气分即在膻中，病在血分即在心包络。临床上膻中、心包络常同病，治疗二者痰阻瘀滞的常用药也基本一致：枳实、桃仁、郁金、瓜蒌籽、石菖蒲等。成方则有大小陷胸法。
有形之固态者：筋骨、皮肉、毛发、脏腑。
中医的脏腑理论是起源于人体解剖的。但是，随着我们对脏腑相互影响的认识越来越深，完全超越了人体解剖所能解释的，特别是脏腑之间的相互影响、疾病的传变，不全是解剖学能够验证。通过人体解剖并结合临床医学实践，医学家们创立了一种部分超出经验的中医理论：藏相学说。藏相学说来源于经验，并不能完全被解剖学所验证，但能被临床医学所验证。
遗憾的是，汉代医学家这种经验与理性并重、归纳和演绎结合的理念，并没有被后代医学家所完全继承。首先是被魏晋玄学神秘化，特别是自赵宋以来，脱离经验、实践去玄谈的风气日益盛行。这导致了藏相学说在汉代以后几无进步。